Salihamidzic bildet ab kommenden Sommer mit Karl-Heinz Rummenigge (Vorsitz), dessen Stellvertreter Jan-Christian Dreesen (Finanzen und Controlling), Andreas Jung (Marketing, Sponsoring und Events) und Jörg Wacker (Internationalisierung und Strategie) den Vorstand der FC Bayern München AG.
Seine unmittelbaren Aufgaben werden sich dadurch zwar nicht verändern, die Beförderung ist für den Ex-Profi aber dennoch sehr wichtig. Salihamidzic stellte im Vorfeld klar, dass er nicht unter einem anderen Sportvorstand arbeiten wolle. Er übernahm im Sommer 2017 das Amt des Sportdirektors. Ein Jahr nach dem Abschied von Matthias Sammer als Sportvorstand.