Seine zweite Leihe weg von Wolverhampton verlief deutlich erfolgreicher. Bei Duisburg erzielte Maierhofer in 32 Spielen nicht nur zwölf Tore, sondern hatte auch großen Anteil am Einzug ins DFB-Pokalfinale des deutschen Zweitligisten, allerdings musste man sich im Endspiel Schalke klar geschlagen geben. Der "Major" köpfte Duisburg ins Finale, in dem er nach einem Mittelfußbruch allerdings nicht zum Einsatz kam.